Tärkeä osa naprapaatin työtä on perusteellinen potilaan tutkiminen ja diagnosointi. Täten paras mahdollinen hoitomuoto ja lähestymistapa voidaan valita. Tutkiminen ja diagnosointi tapahtuu laajan haastattelun sekä aktiivisten ja passiivisten testien kautta. Ensimmäisenä tavoitteena on helpottaa eniten elämää häiritseviä oireita kuten kipua, jonka jälkeen otetaan mukaan muun muassa kotiharjoitteet ja ergonominen ohjaus joilla hoidetaan oireen syitä. Tavoitteena on että potilas pärjää mahdollisimman pian itsenäisesti kotiharjoitteiden, ergonomisen ohjauksen ja neuvonnan ansiosta. 

Mahdollisiin hoitomuotoihin kuuluvat nivelmanipulaatio, nikamamanipulaatio, nivelmobilisaatio, nikamamobilisaatio, hermokudoksen mobilisaatio, mobilisoiva hieronta, erilaiset lihasvenytystekniikat, triggerpistekäsittely, faskiakäsittely ja pehmytkudoskäsittely. Tärkeänä osana hoitoa toimii aktiivinen ja yksilöllinen harjoitusterapia, jossa katsotaan potilaalle sopivat harjoitteet kotiin. Lisäksi hoitoon voi kuulua mm. teippauksia ja lämpöhoitoa. Huom! Hoitomuodot valitaan aina yksilöllisesti tilanteen mukaan ja potilaan kanssa yhdessä keskustellen.